לניקוי העדשות והגומי האוטם של משקפת שחייה, ישנן שיטות שונות.

לניקוי העדשות, ישנן שלוש שיטות עיקריות:

• שיטת המים: זורו מים חמים על העדשות, ואז מספר מעגלים של רוטציה. העדשות יהיו נקיות, משום שהמים יקרעו את החלקיקים.
• שיטת הביסולפט: ישנן שפכים של חומרים אורגניים, והם גורמים לחלקיקים לקרוע.
• שיטת האלקוהול: סחוח שמנה, או משחת אלקוהול, יכולים לשמש לניקוי.

לניקוי הגומי האוטם, ניתן לשים לב לנקודות החלש, ולהסתכל על סוג הגומי.

אם הגומי מסוג S-Tec, הנקודות החלש יהיו בין הזקפים.

אם הגומי מסוג G-Tec, הנקודות החלש יהיו בתחתית.

בכל המקרים, ניתן לנקות את הגומי כפי שנקים את העדשות.