ללמוד להיות מזכירה רפואית, ישנם מספר מוסדות אקדמיים שמאפשרים לצאת עם תואר התכנית.

בישראל, קיימים מספר מוסדות אקדמיים שמלמדים תוכנית מזכירה רפואית, ביניהם:

• האוניברסיטה העברית בירושלים
• אוניברסיטת תל אביב
• אוניברסיטת בר-אילן
• מכללת לוינסקי לחינוך,
• ועוד.

התוכנית בדרך כלל כוללת תאוריה ופרקטיקה, כך שסטודנטים יוכלו לרכוש ידע ומיומנויות עבודה.

מוסדות להשכלה גבוהה בישראל המציעים תוכניות לימודים להיות מזכירה רפואית (ואו "מזכירת הסתיירה" - "Medical Secretary" או "Medical Receptionist") הם:

• מכללת בית ברל - בתוכנית למנהלת רפואית, תלמידות ילמדו על הקשר בין המטופל לבין המטפל, ועל התפקיד של המזכירה הרפואית במרפאה.
• מכללת ספיר - תוכנית למנהלת רפואית, ומכללת ספיר גם היא תלמדנה על תפקידי המזכירה הרפואית.
• מכללת זיו - המכללה גם מלמדת תוכנית למנהלת רפואית בה תלמידים ילמדו על תפקידי המזכירה הרפואית.
• המכללה האקדמית בית ברל

התשובה לשאלה זו תלויה במספר גורמים, כגון תאריך הלימודים, המיקום הגאוגרפי והדרישות המקצועיות. עם זאת, להלן מספר מוסדות אקדמיים ידועים שמציעים תוכניות לימודים להיות מזכירה רפואית:

• קריית הלאומית למדעי הרפואה - האוניברסיטה העברית בירושלים: האוניברסיטה רושמת תוכנית למנהלים רפואיים, שבה ניתן ללמוד עבור תעודת הספרייה הרפואית.
• אוניברסיטת תל אביב - בית הספר למנהל רפואי: המנהל הרפואי באוניברסיטת תל אביב מציעה תוכנית ללימוד, שמבוססת על תכנים של הספרייה וניהול.

ישנן סיבות רבות שיכולו לגרום להתעניינות בקריירה כמזכירה רפואית. היתרונות העיקריים, כמו צעד באפיק קריירה הקשורה לבריאות.